Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK5RAP2Q96SN8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CDK5RAP2Q96SN8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms