Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX18Q96RF0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms