Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX27Q96GQ7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX27Q96GQ7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX27Q96GQ7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX27Q96GQ7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX27Q96GQ7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX27Q96GQ7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX27Q96GQ7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX27Q96GQ7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX27Q96GQ7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX27Q96GQ7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX27Q96GQ7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX27Q96GQ7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX27Q96GQ7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms