Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRAMD1AQ96CP6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRAMD1AQ96CP6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 277 ms