Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPDL3BQ92485 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPDL3BQ92485 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms