Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERVK_113Q902F9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERVK_113Q902F9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HERVK_113Q902F9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms