Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASKIN2Q8WXE0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASKIN2Q8WXE0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms