Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
CASKIN1Q8WXD9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
CASKIN1Q8WXD9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
CASKIN1Q8WXD9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CASKIN1Q8WXD9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CASKIN1Q8WXD9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CASKIN1Q8WXD9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CASKIN1Q8WXD9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CASKIN1Q8WXD9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CASKIN1Q8WXD9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
CASKIN1Q8WXD9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CASKIN1Q8WXD9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CASKIN1Q8WXD9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CASKIN1Q8WXD9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CASKIN1Q8WXD9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CASKIN1Q8WXD9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CASKIN1Q8WXD9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CASKIN1Q8WXD9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
CASKIN1Q8WXD9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CASKIN1Q8WXD9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
CASKIN1Q8WXD9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CASKIN1Q8WXD9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CASKIN1Q8WXD9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CASKIN1Q8WXD9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CASKIN1Q8WXD9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CASKIN1Q8WXD9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CASKIN1Q8WXD9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CASKIN1Q8WXD9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CASKIN1Q8WXD9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CASKIN1Q8WXD9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CASKIN1Q8WXD9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CASKIN1Q8WXD9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CASKIN1Q8WXD9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CASKIN1Q8WXD9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CASKIN1Q8WXD9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CASKIN1Q8WXD9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CASKIN1Q8WXD9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CASKIN1Q8WXD9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CASKIN1Q8WXD9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CASKIN1Q8WXD9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
CASKIN1Q8WXD9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CASKIN1Q8WXD9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CASKIN1Q8WXD9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CASKIN1Q8WXD9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CASKIN1Q8WXD9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms