Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEM1

NUP210, Nuclear pore membrane glycoprotein 210, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP210Q8TEM1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP210Q8TEM1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP210Q8TEM1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP210Q8TEM1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP210Q8TEM1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP210Q8TEM1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP210Q8TEM1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP210Q8TEM1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP210Q8TEM1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP210Q8TEM1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP210Q8TEM1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP210Q8TEM1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP210Q8TEM1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP210Q8TEM1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms