Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEE9

SAP25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP25Q8TEE9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAP25Q8TEE9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SAP25Q8TEE9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAP25Q8TEE9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAP25Q8TEE9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAP25Q8TEE9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAP25Q8TEE9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAP25Q8TEE9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAP25Q8TEE9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAP25Q8TEE9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAP25Q8TEE9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAP25Q8TEE9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAP25Q8TEE9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAP25Q8TEE9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAP25Q8TEE9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAP25Q8TEE9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAP25Q8TEE9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAP25Q8TEE9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAP25Q8TEE9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SAP25Q8TEE9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAP25Q8TEE9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAP25Q8TEE9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAP25Q8TEE9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAP25Q8TEE9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.7 ms