Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT6

NPLOC4, Nuclear protein localization protein 4 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPLOC4Q8TAT6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPLOC4Q8TAT6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NPLOC4Q8TAT6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPLOC4Q8TAT6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms