Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE62

CHDH, Choline dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHDHQ8NE62 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHDHQ8NE62 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHDHQ8NE62 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHDHQ8NE62 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHDHQ8NE62 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHDHQ8NE62 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHDHQ8NE62 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms