Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC44A5Q8NCS7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC44A5Q8NCS7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms