Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL23Q8NBE8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL23Q8NBE8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL23Q8NBE8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms