Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1V2

CFAP52, Cilia- and flagella-associated protein 52, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP52Q8N1V2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP52Q8N1V2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP52Q8N1V2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
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