Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NME9Q86XW9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NME9Q86XW9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NME9Q86XW9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NME9Q86XW9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NME9Q86XW9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NME9Q86XW9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NME9Q86XW9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NME9Q86XW9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NME9Q86XW9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NME9Q86XW9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NME9Q86XW9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NME9Q86XW9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NME9Q86XW9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NME9Q86XW9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NME9Q86XW9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NME9Q86XW9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NME9Q86XW9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NME9Q86XW9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NME9Q86XW9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182 ms