Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NLRP13Q86W25 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.8■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.8■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.77■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
NLRP13Q86W25 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NLRP13Q86W25 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms