Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4N2

TRPM1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM1Q7Z4N2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRPM1Q7Z4N2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRPM1Q7Z4N2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRPM1Q7Z4N2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRPM1Q7Z4N2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRPM1Q7Z4N2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRPM1Q7Z4N2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRPM1Q7Z4N2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRPM1Q7Z4N2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRPM1Q7Z4N2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRPM1Q7Z4N2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRPM1Q7Z4N2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRPM1Q7Z4N2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
TRPM1Q7Z4N2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRPM1Q7Z4N2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRPM1Q7Z4N2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRPM1Q7Z4N2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRPM1Q7Z4N2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRPM1Q7Z4N2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRPM1Q7Z4N2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TRPM1Q7Z4N2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
TRPM1Q7Z4N2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRPM1Q7Z4N2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRPM1Q7Z4N2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRPM1Q7Z4N2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRPM1Q7Z4N2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRPM1Q7Z4N2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRPM1Q7Z4N2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRPM1Q7Z4N2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRPM1Q7Z4N2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 329.8 ms