Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KNDC1Q76NI1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
KNDC1Q76NI1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KNDC1Q76NI1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KNDC1Q76NI1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms