Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
HECW1Q76N89 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
HECW1Q76N89 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
HECW1Q76N89 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
HECW1Q76N89 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
HECW1Q76N89 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
HECW1Q76N89 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
HECW1Q76N89 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
HECW1Q76N89 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
HECW1Q76N89 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
HECW1Q76N89 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
HECW1Q76N89 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
HECW1Q76N89 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
HECW1Q76N89 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
HECW1Q76N89 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
HECW1Q76N89 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
HECW1Q76N89 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
HECW1Q76N89 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
HECW1Q76N89 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
HECW1Q76N89 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
HECW1Q76N89 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
HECW1Q76N89 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC38.3■■■■□ 3.72
HECW1Q76N89 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
HECW1Q76N89 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
HECW1Q76N89 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
HECW1Q76N89 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms