Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP43Q70EL4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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