Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PPP1R3FQ6ZSY5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPP1R3FQ6ZSY5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP1R3FQ6ZSY5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms