Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SRCAPQ6ZRS2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SRCAPQ6ZRS2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SRCAPQ6ZRS2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SRCAPQ6ZRS2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SRCAPQ6ZRS2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
SRCAPQ6ZRS2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SRCAPQ6ZRS2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SRCAPQ6ZRS2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SRCAPQ6ZRS2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SRCAPQ6ZRS2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SRCAPQ6ZRS2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SRCAPQ6ZRS2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SRCAPQ6ZRS2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SRCAPQ6ZRS2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SRCAPQ6ZRS2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SRCAPQ6ZRS2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SRCAPQ6ZRS2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
SRCAPQ6ZRS2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SRCAPQ6ZRS2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SRCAPQ6ZRS2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SRCAPQ6ZRS2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SRCAPQ6ZRS2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
SRCAPQ6ZRS2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SRCAPQ6ZRS2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SRCAPQ6ZRS2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
SRCAPQ6ZRS2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms