Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CXCL17Q6UXB2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CXCL17Q6UXB2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CXCL17Q6UXB2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CXCL17Q6UXB2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CXCL17Q6UXB2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CXCL17Q6UXB2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CXCL17Q6UXB2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CXCL17Q6UXB2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CXCL17Q6UXB2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CXCL17Q6UXB2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CXCL17Q6UXB2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms