Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VSTM1Q6UX27 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VSTM1Q6UX27 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms