Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPE4Q6UWF7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXPE4Q6UWF7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE4Q6UWF7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms