Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI98

INO80C, INO80 complex subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80CQ6PI98 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80CQ6PI98 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80CQ6PI98 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
INO80CQ6PI98 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80CQ6PI98 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80CQ6PI98 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80CQ6PI98 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80CQ6PI98 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms