Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC12Q6PEW1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms