Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X7

TMEM71, Transmembrane protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM71Q6P5X7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM71Q6P5X7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM71Q6P5X7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM71Q6P5X7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM71Q6P5X7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM71Q6P5X7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM71Q6P5X7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM71Q6P5X7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM71Q6P5X7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms