Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2D8

XRRA1, X-ray radiation resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRRA1Q6P2D8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
XRRA1Q6P2D8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XRRA1Q6P2D8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRRA1Q6P2D8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRRA1Q6P2D8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRRA1Q6P2D8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRRA1Q6P2D8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
XRRA1Q6P2D8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRRA1Q6P2D8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRRA1Q6P2D8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRRA1Q6P2D8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRRA1Q6P2D8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XRRA1Q6P2D8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XRRA1Q6P2D8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XRRA1Q6P2D8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XRRA1Q6P2D8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
XRRA1Q6P2D8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
XRRA1Q6P2D8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XRRA1Q6P2D8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
XRRA1Q6P2D8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XRRA1Q6P2D8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
XRRA1Q6P2D8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms