Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
VIRMAQ69YN4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
VIRMAQ69YN4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
VIRMAQ69YN4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms