Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLFN13Q68D06 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLFN13Q68D06 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLFN13Q68D06 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms