Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4I8

C6orf52, Putative uncharacterized protein C6orf52, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf52Q5T4I8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf52Q5T4I8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf52Q5T4I8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf52Q5T4I8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 281.4 ms