Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF14Q5SWL7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAMEF14Q5SWL7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF14Q5SWL7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF14Q5SWL7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF14Q5SWL7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF14Q5SWL7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF14Q5SWL7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF14Q5SWL7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF14Q5SWL7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF14Q5SWL7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF14Q5SWL7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms