Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TTC39AQ5SRH9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTC39AQ5SRH9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TTC39AQ5SRH9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTC39AQ5SRH9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTC39AQ5SRH9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTC39AQ5SRH9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTC39AQ5SRH9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTC39AQ5SRH9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTC39AQ5SRH9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTC39AQ5SRH9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTC39AQ5SRH9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTC39AQ5SRH9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TTC39AQ5SRH9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TTC39AQ5SRH9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TTC39AQ5SRH9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TTC39AQ5SRH9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TTC39AQ5SRH9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms