Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NOM1Q5C9Z4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NOM1Q5C9Z4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms