Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SBK1Q52WX2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SBK1Q52WX2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SBK1Q52WX2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SBK1Q52WX2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SBK1Q52WX2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SBK1Q52WX2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SBK1Q52WX2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SBK1Q52WX2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SBK1Q52WX2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms