Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9L4

C15orf59, UPF0583 protein C15orf59, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf59Q2T9L4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C15orf59Q2T9L4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C15orf59Q2T9L4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C15orf59Q2T9L4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C15orf59Q2T9L4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C15orf59Q2T9L4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C15orf59Q2T9L4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C15orf59Q2T9L4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C15orf59Q2T9L4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C15orf59Q2T9L4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms