Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF9Q16594 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TAF9Q16594 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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