Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NTRK3Q16288 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NTRK3Q16288 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NTRK3Q16288 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms