Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SURF1Q15526 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SURF1Q15526 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms