Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
IKBKEQ14164 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IKBKEQ14164 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IKBKEQ14164 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IKBKEQ14164 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IKBKEQ14164 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
IKBKEQ14164 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IKBKEQ14164 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IKBKEQ14164 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IKBKEQ14164 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IKBKEQ14164 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IKBKEQ14164 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IKBKEQ14164 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IKBKEQ14164 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IKBKEQ14164 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IKBKEQ14164 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IKBKEQ14164 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IKBKEQ14164 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IKBKEQ14164 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IKBKEQ14164 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IKBKEQ14164 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IKBKEQ14164 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IKBKEQ14164 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms