Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKAP5Q14008 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP5Q14008 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
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