Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CBFBQ13951 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CBFBQ13951 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms