Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFAIP1Q13829 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNFAIP1Q13829 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNFAIP1Q13829 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
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