Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SQSTM1Q13501 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SQSTM1Q13501 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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