Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSLNQ13421 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSLNQ13421 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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