Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3BQ13214 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEMA3BQ13214 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
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