Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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