Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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